1966年，年已84岁的颜福庆，被关进牛棚隔离审查，多次遭受批斗，头戴高帽“资产阶级反动学术权威的祖师爷”，胸前挂牌“我是混蛋”，一边敲打铁皮簸箕，一边口号：“我是牛鬼蛇神”“我是资产阶级反动学术权威”。 在自己创办的上海医学院校园，他被游斗，供人随意唾骂、推打、凌辱。家门口也被刷上打倒反动学术权威颜福庆的大标语，此后卧病不起。 一位工宣队员曾要求颜自杀以谢人民，但他一直保持乐观，表示自己不会自杀